SMA Negeri 1 Pondok Kelapa Bengkulu Utara mulai menerima siswa pada bulan Juli 1991 yang masih bergabung di SMP Negeri 1 Pondok Kelapa. Pada saat itu PLT yang menjabat Kepala Sekolah adalah Drs. Anwar Rasyid. Pada tanggal 30 April 1992 berlokasi di lapangan Sepak Bola Desa Pasar Pedati, tepatnya 12 Km dari Pusat Ibukota Propinsi Bengkulu, SMA Negeri 1 Pondok Kelapa Bengkulu Utara di resmikan oleh Wakil Gubernur KDH TK I. Bengkulu Usup Supriyadi. Berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 0218/C/1992 SMA Negeri 1 Pondok Kelapa Bengkulu Utara resmi didirikan sekaligus memperoleh Surat Keputusan Izin Operasional dan Surat Keputusan Status Negeri dengan Nama SMA Negeri 1 Pondok Kelapa Kabupaten Bengkulu Utara pada tanggal 5 Mei 1992. Pada saat ini baru memiliki 3 ruang belajar dan 1 laboratorium IPA. Kepala Sekolah pertama dijabat oleh Drs. Firmansyah dengan masa jabatan dari tahun 1992 hingga 1995. Kepala Sekolah kedua dijabat oleh Drs. Yusra Tanjung dari tahun 1995 hingga tahun 2001. Kepala Sekolah ketiga dijabat oleh Drs. Sukarmin yang hanya sempat menjabat selama lebih kurang 7 bulan di tahun 2001. Kepala Sekolah keempat dijabat oleh Drs. Dasimun dari tahun 2001 hingga 2009. Kepala sekolah kelima dijabat oleh Drs. Rusman Effendi dari tahun 2009 hingga tahun 2012. Kepala Sekolah keenam dijabat oleh Manogu Sinabutar, S.Pd dari bulan Maret 2013 hingga Januari 2019. Namun pada peralihan jabatan tersebut sempat terjadi kekosongan jabatan, maka di isi oleh PLT. Kepala Sekolah selama kurang lebih satu semester oleh Dra. Susilowati. Kini SMA Negeri 3 Bengkulu Tengah Kepala Sekolah dijabat oleh Bapak Rachmat Wibowo Pora Utama, M.Pd.Si.

          Seiring pemekaran Kabupaten Bengkulu Tengah tahun 2008, SMA Negeri 1 Pondok Kelapa Bengkulu Utara berubah nama menjadi SMA Negeri 1 Pondok Kelapa dan akhirnya berdasarkan Surat Keputusan Bupati  Nomor 385 Tahun 2012 pada tanggal 27 November 2012 terjadi perubahan nomenklatur sekolah yang ada di Kabupaten Bengkulu Tengah sehingga menjadi SMA Negeri 3 Bengkulu Tengah. Berdasarkan Surat Keputusan Badan Akreditasi Nasional Nomor Ma.014376 tanggal 14 November 2012 SMA Negeri 3 Bengkulu Tengah mendapatkan Akreditasi A dengan status mutu Rintisan Sekolah Standar Nasional dari tahun 2010. Pada Tahun 2018 Kembali mendapatkan Akreditasi A Unggul dan sempat menyandang status sebagai Sekolah Rujukan.

          Selama lebih kurang 21 tahun, telah banyak kemajuan berkat berbagai program pengembangan yang dilaksanakan dalam beberapa tahun terakhir. Pada tahun 2019 ini SMA Negeri 3 Bengkulu Tengah telah memiliki 27 rombongan belajar, 5 ruang laboratorium, dan jaringan internet fiber yang didukung tidak kurang dari 50 unit komputer serta keamanan yang didukung cctv di setiap sudut dan ruang. Dengan jumlah tenaga pendidik 62 orang dan 15 tenaga administrasi diharapkan dapat memimbing dan membantu siswa yang sebanyak 800 lebih meraih prestasi dan cita-citanya. Bahkan sungguh disayangkan pada tahun pelajaran baru 2019/2020 SMAN Negeri 3 Bengkulu Tengah terpaksa tidak menerima beberapa siswa pendaftar dari jalur online karena melebihi daya tampung.